Introdução à Dinâmica Molecular
Introdução à simulação de dinâmica molecular de proteínas em caixa d'água
Description
A Dinâmica Molecular (DM) é uma poderosa técnica computacional que simula o movimento dos átomos de uma molécula ou um complexo ao longo do tempo. Essa abordagem permite explorar as interações atômicas de biomoléculas (e outros materiais) em escala atômica e em um ambiente virtual, possibilitando o estudo detalhado de fenômenos biológicos, químicos e físicos em nível molecular.
A DM possui grande importância em diversas áreas da ciência, como biologia, química e física. O escopo deste curso é entender a DM dentro da área da biologia computacional. Nesse sentido, destaco a importância dessa técnica para o estudo da estrutura e função de proteínas e de complexos proteína-ligante, essencial para a pesquisa de novos medicamentos, também conhecido por drug discovery.
No curso de Introdução à Dinâmica Molecular iremos explorar, teoricamente, as bases da técnica aplicada ao estudo de proteínas e complexos proteína-ligante. Estudaremos o passo a passo para a realização de uma simulação de DM, passando pelas formas mais comuns de análises das trajetórias e finalizaremos com algumas aplicações. Para este curso, utilizei como base o protocolo de DM utilizando o pacote GROMACS, que é gratuito.
Se você tem conhecimento básico sobre estruturas de proteínas, esse curso é para você! Não é necessário ter conhecimento em programação!
Este curso é pensado para auxiliar estudantes e pesquisadores que querem trabalhar ou trabalham com essa área, não deixe de adquiri-lo para dar um up na sua carreira e pesquisa!
What You Will Learn!
- Visão geral sobre as simulações de Dinâmica Molecular (DM) de proteínas
- O que são campos de força e sua importância na DM
- Passo a passo, teórico, das etapas de DM utilizando o GROMACS
- Análises das trajetórias de DM e a aplicação da técnica
Who Should Attend!
- Alunos e pesquisadores que desejam conhecer e aplicar simulação de dinâmica molecular em seus estudos e pesquisas.